L’estuaire de la Gironde se caractérise par une diversité de milieux et d’enjeux environnementaux liés à ces milieux . Dans une première partie, nous envisagerons à travers ce travail de synthèse l’enjeu de la qualité de l’eau et de l’écosystème estuarien lié puis dans une seconde partie, l’enjeu de la biodiversité sera développé au travers des espèces, des milieux concernés ainsi que les protections et dispositifs réglementaires existants.