Les polluants dits « émergents » sont pour la plupart mal connus et les méthodes permettant leur surveillance sont souvent peu robustes. Le processus d’identification de ces polluants par de vastes campagnes prospectives puis leur mise en surveillance réglementaire se heurtent donc parfois à des problématiques techniques liées à l’échantillonnage ou à l’analyse. AQUAREF, le laboratoire national de référence pour la surveillance des milieux aquatiques, a contribué à l’ensemble de ce processus, depuis les campagnes prospectives jusqu’à la déclinaison opérationnelle dans la réglementation nationale. Les campagnes nationales récentes ont montré le besoin de prendre en compte de façon précoce les questions de fiabilité des données. Concernant l’échantillonnage par exemple, la maitrise des contaminations ainsi que la connaissance de la stabilité des substances sont apparues comme des points clés pour la fiabilité des données. Suite aux campagnes prospectives, il est nécessaire de permettre une mise en surveillance régulière fiable de ces substances par des recommandations techniques réalistes et adaptées aux besoins des gestionnaires. Enfin AQUAREF joue également un rôle dans le processus de transfert de méthodes vers les laboratoires prestataires. Tous ces éléments ne sont pas spécifiques des polluants émergents mais il semble indispensable qu’ils soient pris en compte très tôt dans le processus d’identification et de surveillance de ce type de polluants.