Les processus biologiques clés tels que la nitrification ne sont pas le résultat du travail d'une seule espèce bactérienne mais sont effectués par une grande variété de bactéries. Toutefois, cette diversité microbienne et sa variabilité ne sont généralement pas suivies dans les procédés en cours de fonctionnement et négligées dans la plupart des modèles mathématiques actuels. Ces derniers distinguent au mieux une flore qui oxyde l'ammonium et une autre oxydant les nitrites, en supposant les mêmes propriétés pour toutes les bactéries de chaque groupe. Néanmoins, des évidences expérimentales sont disponibles montrant que les différentes conditions de fonctionnement des procédés favorisent la sélection de différents types de bactéries. Cette contribution traite des différences observées entre deux réacteurs nitrifiants à lit turbulé inverse contenant différents taux de solide et de l'évolution de sa communauté nitrifiante en fonction des changements de conditions d'exploitation dans l'un de ces réacteurs. Le comportement des réacteurs est décrit par un modèle en deux étapes qui inclue la concurrence entre deux populations oxydant l'ammonium, en plus d'une population oxydant les nitrites. La concentration en oxygène est la variable clé régissant le changement de populations, l'influence des paramètres de croissance microbienne sur la concurrence dynamique est évaluée.