L'objet de la présente contribution est, à partir de la surveillance en place et en fonction de l'évolution très actuelle du contexte réglementaire, de présenter certaines pistes et des travaux scientifiques en cours impliquant notamment l'Unité de Recherches Qualité des Eaux, susceptibles d'améliorer la connaissance scientifique et d'aider à une évolution du dispositif de surveillance-évaluation ou des pratiques de gestion des milieux aquatiques.